Bahagian	Bahagian Penyelidikan
Alamat	Bahagian Penyelidikan, Aras 1, Blok A, Pusat Islam Iskandar Johor, Jalan Masjid Abu Bakar, Karung Berkunci 725, 80990 Johor Bahru, Johor.
Ketua Bahagian	Tuan Haji Ahmad Hanif bin Naim
Nombor Telefon	07-2076394
Faks	07-2076395

Visi

“Mengukuhkan Perlaksanaan Maqasid Syariah (Islam, Iman Dan Ihsan) Dalam Urus Tadbir Agama Islam”

Misi

“Kearah Menjayakan Visi Maqasid Syariah Dalam Urus Tadbir Jabatan Agama Islam Negeri Johor Melalui Penyelidikan Pelbagai Method Yang Efektif Demi Kepentingan Umat Islam”

Fungsi Utama

1. Menjayakan segala objektif dan fungsi bahagian-bahagian Jabatan Agama Islam Negeri Johor, Majlis Agama Islam Negeri Johor, Jabatan Mufti Negeri Johor dan Mahkamah Kehakiman Syariah.
2. Membuka dan menyediakan ruang penyelidikan dan kajian yang berkaitan dengan hal ehwal Islam di Negeri Johor.
3. Menerbit, menyemak dan menyimpan bahan terbitan Agama Islam sebagai rujukan.
4. Menjayakan program pengukuhan Ahli Sunnah Wal Jamaah dalam bentuk penulisan, Multaqa, Dakwah Bil Hal dan sebagainya.
5. Menyediakan perkhidmatan Pelupusan Al-Quran demi menjayakan Maqasid Syariah.
6. Menerima aduan awam dan Menyediakan laporan lengkap penyelidikan terhadap isu-isu keagamaan Islam yang dibangkitkan kepada Jabatan Mufti Negeri Johor, dan Kerajaan untuk tujuan fatwa dan pemewartaan.
7. Memantau bahan terbitan media masa (whatsapss/ facebook/ twitter/ Instagram), bercetak yang bertentangan dengan ASWJ.

1. Membuat tindakan ke atas aduan fahaman dan ajaran yang bertentangan dengan Akidah Ahli Sunnah Wal Jamaah dalam tempoh empat belas (14) hari berekrja atau mengikut keperluan kes selepas aduan lengkap diterima.
2. Membuat tindakan ke atas aduan penapisan dan siasatan media dengan tujuan pencegahan, pengedaran dan penyebaran Al-Quran dan tafsir, buku-buku agama, majalah, video/cakera padat dan perhiasan yang mengandungi ayat Al-Quran yang didapati salah dalam tempoh empat belas (14) hari berekrja atau mengikut keperluan kes selepas aduan yang diterima lengkap dengan bahan terbitan.